Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5E6

Gga2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga2Q6P5E6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gga2Q6P5E6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gga2Q6P5E6 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms