Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF2Q12947 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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