Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCL9Q07325 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms