Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CFHR1Q03591 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CFHR1Q03591 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms