Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCN7AQ01118 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCN7AQ01118 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms