Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLTCQ00610 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLTCQ00610 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms