Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CABP4P57796 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CABP4P57796 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CABP4P57796 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CABP4P57796 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms