Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SMARCA2P51531 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SMARCA2P51531 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms