Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJA4P35212 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
GJA4P35212 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
GJA4P35212 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms