Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPS1P31327 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPS1P31327 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPS1P31327 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CPS1P31327 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPS1P31327 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPS1P31327 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPS1P31327 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPS1P31327 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPS1P31327 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPS1P31327 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPS1P31327 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CPS1P31327 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CPS1P31327 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CPS1P31327 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CPS1P31327 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPS1P31327 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CPS1P31327 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms