Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF2E1P29083 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms