Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Edn1P22387 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Edn1P22387 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms