Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TRHP20396 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRHP20396 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRHP20396 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRHP20396 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRHP20396 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRHP20396 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRHP20396 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms