Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP3P12645 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP3P12645 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP3P12645 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP3P12645 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP3P12645 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP3P12645 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP3P12645 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP3P12645 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BMP3P12645 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BMP3P12645 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BMP3P12645 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BMP3P12645 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BMP3P12645 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms