Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RARBP10826 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RARBP10826 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RARBP10826 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RARBP10826 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RARBP10826 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RARBP10826 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RARBP10826 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms