Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHGAP10645 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHGAP10645 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHGAP10645 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHGAP10645 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHGAP10645 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms