Protein–RNA interactions for Protein: P01375

TNF, Tumor necrosis factor, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFP01375 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFP01375 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFP01375 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFP01375 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFP01375 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms