Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLR1AO95602 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
POLR1AO95602 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms