Protein–RNA interactions for Protein: G3UW88

Gm44, MCG65130, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm44G3UW88 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm44G3UW88 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm44G3UW88 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm44G3UW88 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm44G3UW88 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm44G3UW88 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm44G3UW88 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm44G3UW88 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm44G3UW88 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm44G3UW88 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms