Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPBD1B2RD01 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms