Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 535 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
EHD3Q9NZN3 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
EHD3Q9NZN3 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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