Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
HOXD1Q9GZZ0 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
HOXD1Q9GZZ0 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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