Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
KRTAP9-3Q9BYQ3 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.2 ms