Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
FAM3DQ96BQ1 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
FAM3DQ96BQ1 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 260.3 ms