Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
HERC1Q15751 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR363-201ENST00000384840 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-737P-201ENST00000365370 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 SNORD115-45-201ENST00000391078 81 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
HERC1Q15751 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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