Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NFIXQ14938 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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