Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 SNORD115-40-201ENST00000606510 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
ERV3-1Q14264 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERV3-1Q14264 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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