Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.06□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
SNX1Q13596 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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SNX1Q13596 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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SNX1Q13596 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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SNX1Q13596 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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SNX1Q13596 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
SNX1Q13596 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
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SNX1Q13596 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SNX1Q13596 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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