Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
TOP3AQ13472 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TOP3AQ13472 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms