Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CLN3Q13286 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
CLN3Q13286 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLN3Q13286 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLN3Q13286 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLN3Q13286 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLN3Q13286 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CLN3Q13286 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CLN3Q13286 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CLN3Q13286 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CLN3Q13286 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLN3Q13286 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLN3Q13286 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLN3Q13286 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLN3Q13286 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
CLN3Q13286 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLN3Q13286 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLN3Q13286 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLN3Q13286 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
CLN3Q13286 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
CLN3Q13286 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CLN3Q13286 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.54□□□□□ -2
CLN3Q13286 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLN3Q13286 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
CLN3Q13286 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CLN3Q13286 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CLN3Q13286 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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