Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
ERCC8Q13216 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.08□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
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ERCC8Q13216 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
ERCC8Q13216 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.02□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
ERCC8Q13216 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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