Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ECH1Q13011 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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