Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
FOXF1Q12946 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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FOXF1Q12946 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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FOXF1Q12946 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
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FOXF1Q12946 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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FOXF1Q12946 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
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FOXF1Q12946 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
FOXF1Q12946 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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