Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
GTF3C1Q12789 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.59□□□□□ -2.32
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GTF3C1Q12789 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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GTF3C1Q12789 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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GTF3C1Q12789 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
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GTF3C1Q12789 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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GTF3C1Q12789 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
GTF3C1Q12789 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
GTF3C1Q12789 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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