Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VPREB1P12018 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.58□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU4-84P-201ENST00000364200 139 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
VPREB1P12018 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
VPREB1P12018 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms