Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CRXO43186 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CRXO43186 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CRXO43186 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CRXO43186 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CRXO43186 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
CRXO43186 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CRXO43186 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CRXO43186 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CRXO43186 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CRXO43186 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CRXO43186 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CRXO43186 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
CRXO43186 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CRXO43186 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CRXO43186 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CRXO43186 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
CRXO43186 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CRXO43186 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CRXO43186 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CRXO43186 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CRXO43186 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CRXO43186 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CRXO43186 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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