Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NTRK3Q16288 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NTRK3Q16288 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NTRK3Q16288 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NTRK3Q16288 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NTRK3Q16288 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NTRK3Q16288 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NTRK3Q16288 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NTRK3Q16288 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NTRK3Q16288 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NTRK3Q16288 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NTRK3Q16288 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
NTRK3Q16288 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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