Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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GRIK4Q16099 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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GRIK4Q16099 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
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GRIK4Q16099 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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GRIK4Q16099 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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GRIK4Q16099 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
GRIK4Q16099 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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