Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ODF1Q14990 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
ODF1Q14990 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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