Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
COL9A3Q14050 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
COL9A3Q14050 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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