Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NEUROD1Q13562 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 AC108729.3-201ENST00000513484 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
NEUROD1Q13562 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
NEUROD1Q13562 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.2 ms