Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
RIPK1Q13546 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
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RIPK1Q13546 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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RIPK1Q13546 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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RIPK1Q13546 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RIPK1Q13546 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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