Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B2Q13435 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B2Q13435 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
SF3B2Q13435 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
SF3B2Q13435 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SF3B2Q13435 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SF3B2Q13435 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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