Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RESTQ13127 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RESTQ13127 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RESTQ13127 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 366.3 ms