Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
RESTQ13127 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
RESTQ13127 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
RESTQ13127 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 AC008133.2-201ENST00000624540 351 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
RESTQ13127 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RESTQ13127 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RESTQ13127 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RESTQ13127 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
RESTQ13127 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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