Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 AC091932.4-201ENST00000623386 200 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ECH1Q13011 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ECH1Q13011 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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