Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
HOXC5Q00444 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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HOXC5Q00444 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXC5Q00444 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXC5Q00444 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
HOXC5Q00444 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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