Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU1-95P-201ENST00000516357 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU1-128P-201ENST00000516704 160 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGPEP1Q9NXJ5 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGPEP1Q9NXJ5 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGPEP1Q9NXJ5 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGPEP1Q9NXJ5 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGPEP1Q9NXJ5 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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