Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS5

OTOP3, Otopetrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
OTOP3Q7RTS5 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
OTOP3Q7RTS5 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 465.9 ms