Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CCDC6Q16204 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR1267-201ENST00000408723 78 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.241-201ENST00000364470 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AC021506.2-201ENST00000612354 169 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.351-201ENST00000365436 96 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
CCDC6Q16204 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC6Q16204 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC6Q16204 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC6Q16204 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC6Q16204 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC6Q16204 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC6Q16204 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC6Q16204 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC6Q16204 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC6Q16204 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
CCDC6Q16204 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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