Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
GRIK4Q16099 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK4Q16099 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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